All'inizio degli anni '90, sollecitato da un progetto del prof. Vallega (Preside dell'allora Facoltà di Magistero dell'Università di Genova) il prof. Ferrero si dedicò all' organizzazione dell'Aula di Informatica che fu un vero successo ed una operazione pionieristica per le facoltà umanistiche dell' Ateneo genovese.
Nel fare ciò, Giovanni Ferrero mise a frutto l'esperienza nell'ambito informatico che già da alcuni anni aveva maturato per le necessità dei propri studi.
Infatti il "dover mettere insieme per tali ricerche testi greci e non, immagini ed espressioni matematiche rendeva quasi impossibile la loro pubblicazione per gli altissimi costi della composizione tipografica". Così egli si accostò "al mondo dell'informatica e di quei computer che allora permettevano l'inserimento di immagini, la scrittura di testi greci polifonici", cosicché fosse possibile agli studiosi comprendere il senso profondo delle "rappresentazioni figurali composte secondo un codice derivante dalla struttura semplicemente tecnica della cosmologia arcaica"*).
Il prof. Ferrero fu responsabile dell'Aula di Informatica, che dal niente aveva costruito, per dieci anni; cioè fino al 2000, quando il preside di facoltà, interessato più alla gestione politica del potere accademico che alle necessità culturali della ricerca, lo estromise dal suo incarico, che venne affidato ad un tecnico.
Negli anni in cui ne ebbe la direzione, il prof. Ferrero svolse vari corsi di perfezionamento relativi alle metodologie multimediali per la formazione a distanza, nonché aggiornamenti per la sua facoltà sulla trasformazione della ricerca accademica nelle Università estere e italiane a seguito dell'applicazione dell'informatica agli studi.